Lähijunaliikenne
Lähijunaliikenne muodostaa yhdessä metroliikenteen kanssa Helsingin seudun joukkoliikenneverkon rungon. Kaikki radat alkavat Helsingin rautatieasemalta ja jatkavat Pasilan kautta eri suuntiin. Ratojen suuri perusparannus käynnistyi 1960-luvulla. Ensimmäiset sähköjunat tulivat lähiliikenteeseen vuonna 1969.
Kaupunkiradat ovat Ratahallintokeskuksen ja kaupunkien yhdessä toteuttamia lisäraiteita tiheästi liikennöidyille rataosuuksille pääkaupunkiseudulla. Martinlaakson rata valmistui vuonna 1975 ja sitä jatkettiin Vantaankoskelle vuonna 1991. Kaupunkirata Helsingistä Tikkurilaan valmistui vuonna 1996. Tikkurilan ja Keravan välinen kaupunkirata valmistui 2004. Leppävaaran kaupunkiradan käyttöönotto vuonna 2002 mahdollisti vuorotarjonnan olennaisen lisäämisen Helsingin ja Leppävaaran välillä. Samalla suurin osa Leppävaaran ja Helsingin välisistä suorista bussiyhteyksistä lakkautettiin ja muutettiin liityntäliikenteeksi Leppävaaran asemalle. Pääkaupunkiseudun liikennejärjestelmäsuunnitelman (PLJ 2007) mukaan kaupunkirataa on tarkoitus jatkaa Leppävaarasta Espoon keskukseen.
Syksyllä 2006 valmistunut Keravan ja Lahden välinen oikorata nopeutti Helsingin seudun ja Lahden välistä junaliikennettä huomattavasti ja houkutteli varsinkin työmatkalaisia kiskoliikenteen käyttäjiksi.
Rakenteilla oleva Kehärata yhdistää uudella rataosalla Vantaankosken radan päärataan jatkamalla Vantaankosken rataa Helsinki-Vantaan lentoaseman kautta Hiekkaharjuun. Rata on tarkoitus avata vuonna 2014.
Pisara-rata on Helsingin keskustaan suunniteltu maan alla kulkeva paikallisjunarata. Rata helpottaisi päärautatieaseman ruuhkaa ohjaamalla junat Pasilasta pisaran muotoiselle ratalenkille, jolla olisi vaihtoyhteys metroon Hakaniemessä sekä mahdollisesti myös Töölössä.
HSL vastaa lähijunaliikenteen palvelutason määrittelystä ja tilaamisesta. Liikennöinnistä ja sen suunnittelusta vastaa VR. Liikenneviraston Rautatieosasto vastaa ratojen suunnittelusta, rakentamisesta ja ylläpidosta.